MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 22155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021881	TTC	2	6	178379	178384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464204
3002	NC_021881	CCT	2	6	178395	178400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464204
3003	NC_021881	T	6	6	178422	178427	0 %	100 %	0 %	0 %	526464204
3004	NC_021881	CA	3	6	178485	178490	50 %	0 %	0 %	50 %	526464204
3005	NC_021881	TTCT	2	8	178491	178498	0 %	75 %	0 %	25 %	526464204
3006	NC_021881	TTC	2	6	178540	178545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464204
3007	NC_021881	AGCC	2	8	178643	178650	25 %	0 %	25 %	50 %	526464204
3008	NC_021881	ACA	2	6	178708	178713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464204
3009	NC_021881	CAC	2	6	178876	178881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464204
3010	NC_021881	TTA	2	6	178901	178906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464204
3011	NC_021881	CAT	2	6	178929	178934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464204
3012	NC_021881	TA	3	6	179137	179142	50 %	50 %	0 %	0 %	526464205
3013	NC_021881	GAT	2	6	179337	179342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464205
3014	NC_021881	TAA	2	6	179356	179361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464205
3015	NC_021881	ATG	2	6	179372	179377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464205
3016	NC_021881	TCT	2	6	179387	179392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464205
3017	NC_021881	TGC	2	6	179394	179399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464205
3018	NC_021881	C	6	6	179546	179551	0 %	0 %	0 %	100 %	526464205
3019	NC_021881	CAA	2	6	179587	179592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464205
3020	NC_021881	GAACA	2	10	179770	179779	60 %	0 %	20 %	20 %	526464205
3021	NC_021881	CCTT	2	8	180083	180090	0 %	50 %	0 %	50 %	526464206
3022	NC_021881	ACC	2	6	180223	180228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464206
3023	NC_021881	GCTT	2	8	180272	180279	0 %	50 %	25 %	25 %	526464206
3024	NC_021881	ACCC	2	8	180307	180314	25 %	0 %	0 %	75 %	526464206
3025	NC_021881	TTG	2	6	180329	180334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464206
3026	NC_021881	GCA	2	6	180404	180409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464206
3027	NC_021881	CCA	2	6	180519	180524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464206
3028	NC_021881	CAA	2	6	180534	180539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464206
3029	NC_021881	CCAC	2	8	180593	180600	25 %	0 %	0 %	75 %	526464206
3030	NC_021881	GAT	2	6	180972	180977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464207
3031	NC_021881	GTG	2	6	181003	181008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464207
3032	NC_021881	CCT	3	9	181009	181017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464207
3033	NC_021881	CAG	2	6	181042	181047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464207
3034	NC_021881	CTG	2	6	181133	181138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464207
3035	NC_021881	TAA	2	6	181153	181158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464207
3036	NC_021881	AGC	2	6	181292	181297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464207
3037	NC_021881	GAA	2	6	181316	181321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464207
3038	NC_021881	TAG	2	6	181429	181434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464207
3039	NC_021881	GA	3	6	181506	181511	50 %	0 %	50 %	0 %	526464207
3040	NC_021881	TGT	2	6	181522	181527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464207
3041	NC_021881	TAG	2	6	181563	181568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464207
3042	NC_021881	TAC	2	6	181634	181639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464207
3043	NC_021881	GCA	2	6	181651	181656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464207
3044	NC_021881	ATG	2	6	181713	181718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464207
3045	NC_021881	AAT	2	6	181806	181811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464207
3046	NC_021881	GGAA	2	8	181851	181858	50 %	0 %	50 %	0 %	526464207
3047	NC_021881	GAA	2	6	181869	181874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464207
3048	NC_021881	CCA	2	6	181926	181931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464207
3049	NC_021881	ATT	2	6	181935	181940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464207
3050	NC_021881	AG	3	6	181981	181986	50 %	0 %	50 %	0 %	526464207
3051	NC_021881	A	6	6	182050	182055	100 %	0 %	0 %	0 %	526464207
3052	NC_021881	GTA	2	6	182209	182214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464207
3053	NC_021881	TGT	2	6	182252	182257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464207
3054	NC_021881	AACAA	2	10	182262	182271	80 %	0 %	0 %	20 %	526464207
3055	NC_021881	GCAGA	2	10	182334	182343	40 %	0 %	40 %	20 %	526464207
3056	NC_021881	CAA	2	6	182362	182367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464207
3057	NC_021881	GCAAA	2	10	182387	182396	60 %	0 %	20 %	20 %	526464207
3058	NC_021881	TCT	2	6	182722	182727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464781
3059	NC_021881	CCA	2	6	183687	183692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464782
3060	NC_021881	AC	3	6	183793	183798	50 %	0 %	0 %	50 %	526464782
3061	NC_021881	ACC	2	6	183819	183824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464782
3062	NC_021881	GCA	2	6	183839	183844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464782
3063	NC_021881	CCA	2	6	184123	184128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464208
3064	NC_021881	CGC	2	6	184133	184138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464208
3065	NC_021881	TA	3	6	184260	184265	50 %	50 %	0 %	0 %	526464208
3066	NC_021881	CAA	2	6	184271	184276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464208
3067	NC_021881	ATC	2	6	184287	184292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464208
3068	NC_021881	AAT	2	6	184375	184380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464208
3069	NC_021881	AT	3	6	184584	184589	50 %	50 %	0 %	0 %	526464208
3070	NC_021881	CTT	2	6	184779	184784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464208
3071	NC_021881	GTC	2	6	184815	184820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464208
3072	NC_021881	TCT	2	6	184838	184843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464208
3073	NC_021881	AGA	2	6	184916	184921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464208
3074	NC_021881	TCC	2	6	184984	184989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464208
3075	NC_021881	GAA	2	6	185169	185174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464208
3076	NC_021881	ACT	2	6	185202	185207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464208
3077	NC_021881	CAA	2	6	185243	185248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464208
3078	NC_021881	CGG	2	6	185249	185254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464208
3079	NC_021881	CAG	2	6	185291	185296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464208
3080	NC_021881	CTC	2	6	185373	185378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464208
3081	NC_021881	CGC	2	6	185412	185417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464208
3082	NC_021881	ACT	2	6	185446	185451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464208
3083	NC_021881	TCT	2	6	185467	185472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464208
3084	NC_021881	TGGA	2	8	185478	185485	25 %	25 %	50 %	0 %	526464208
3085	NC_021881	C	6	6	185490	185495	0 %	0 %	0 %	100 %	526464208
3086	NC_021881	CCT	3	9	185525	185533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464208
3087	NC_021881	CAG	2	6	185906	185911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464208
3088	NC_021881	CTGAAC	2	12	186006	186017	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526464208
3089	NC_021881	GTAC	2	8	186046	186053	25 %	25 %	25 %	25 %	526464208
3090	NC_021881	CTT	2	6	186089	186094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464208
3091	NC_021881	TTCT	2	8	186129	186136	0 %	75 %	0 %	25 %	526464208
3092	NC_021881	AGC	2	6	186189	186194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464208
3093	NC_021881	GCC	2	6	186209	186214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464208
3094	NC_021881	ACCT	2	8	186233	186240	25 %	25 %	0 %	50 %	526464208
3095	NC_021881	TCG	2	6	186271	186276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464208
3096	NC_021881	AAC	2	6	186349	186354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464208
3097	NC_021881	CTT	2	6	186386	186391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464208
3098	NC_021881	AGG	2	6	186397	186402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464208
3099	NC_021881	GTT	2	6	186419	186424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464208
3100	NC_021881	CCA	2	6	186574	186579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464208
3101	NC_021881	CTT	2	6	186589	186594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464208
3102	NC_021881	ATC	2	6	186615	186620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464208
3103	NC_021881	GTTT	2	8	186977	186984	0 %	75 %	25 %	0 %	526464783
3104	NC_021881	CTG	2	6	186999	187004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464783
3105	NC_021881	ATAC	2	8	187005	187012	50 %	25 %	0 %	25 %	526464783
3106	NC_021881	TAC	2	6	187030	187035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464783
3107	NC_021881	AGT	2	6	187049	187054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464783
3108	NC_021881	CAA	2	6	187062	187067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464783
3109	NC_021881	GCA	2	6	187101	187106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464783
3110	NC_021881	ATAGC	2	10	187107	187116	40 %	20 %	20 %	20 %	526464783
3111	NC_021881	GCA	2	6	187188	187193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464783
3112	NC_021881	T	6	6	187212	187217	0 %	100 %	0 %	0 %	526464783
3113	NC_021881	GTA	2	6	187243	187248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464783
3114	NC_021881	ACA	2	6	187249	187254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464783
3115	NC_021881	CAA	3	9	187257	187265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464783
3116	NC_021881	AGGA	2	8	187274	187281	50 %	0 %	50 %	0 %	526464783
3117	NC_021881	ATT	2	6	187334	187339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464783
3118	NC_021881	ACA	2	6	187410	187415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464209
3119	NC_021881	ATA	2	6	187458	187463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464209
3120	NC_021881	ATG	2	6	187580	187585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464209
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3122	NC_021881	GAAA	2	8	187748	187755	75 %	0 %	25 %	0 %	526464209
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3365	NC_021881	A	7	7	203862	203868	100 %	0 %	0 %	0 %	526464219
3366	NC_021881	TGC	2	6	203885	203890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464219
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3396	NC_021881	TAG	3	9	205516	205524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464794
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3462	NC_021881	T	6	6	211050	211055	0 %	100 %	0 %	0 %	526464222
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3465	NC_021881	CAA	2	6	211250	211255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464222
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3468	NC_021881	TG	3	6	211369	211374	0 %	50 %	50 %	0 %	526464222
3469	NC_021881	GCT	2	6	211418	211423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464222
3470	NC_021881	TAG	2	6	211447	211452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464222
3471	NC_021881	ATG	2	6	211489	211494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464222
3472	NC_021881	CCA	2	6	211528	211533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464222
3473	NC_021881	CTA	3	9	211577	211585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464222
3474	NC_021881	TCA	3	9	211591	211599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464222
3475	NC_021881	TA	3	6	211674	211679	50 %	50 %	0 %	0 %	526464222
3476	NC_021881	AT	3	6	211724	211729	50 %	50 %	0 %	0 %	526464222
3477	NC_021881	AG	3	6	211839	211844	50 %	0 %	50 %	0 %	526464222
3478	NC_021881	TCACTG	2	12	211894	211905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526464222
3479	NC_021881	GGTAT	2	10	211973	211982	20 %	40 %	40 %	0 %	526464222
3480	NC_021881	GGGTG	2	10	211984	211993	0 %	20 %	80 %	0 %	526464222
3481	NC_021881	TTC	2	6	212025	212030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464222
3482	NC_021881	A	6	6	212046	212051	100 %	0 %	0 %	0 %	526464222
3483	NC_021881	T	6	6	212122	212127	0 %	100 %	0 %	0 %	526464222
3484	NC_021881	TAC	2	6	212421	212426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464222
3485	NC_021881	AT	3	6	212489	212494	50 %	50 %	0 %	0 %	526464222
3486	NC_021881	TACT	2	8	212507	212514	25 %	50 %	0 %	25 %	526464222
3487	NC_021881	CTA	2	6	213408	213413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464796
3488	NC_021881	T	6	6	213417	213422	0 %	100 %	0 %	0 %	526464796
3489	NC_021881	TCT	2	6	213488	213493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464796
3490	NC_021881	TAC	2	6	213543	213548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464796
3491	NC_021881	ACTGA	2	10	214444	214453	40 %	20 %	20 %	20 %	526464797
3492	NC_021881	GTG	2	6	214972	214977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464797
3493	NC_021881	TCA	2	6	215000	215005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464797
3494	NC_021881	GC	3	6	215498	215503	0 %	0 %	50 %	50 %	526464798
3495	NC_021881	ACA	2	6	216578	216583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464223
3496	NC_021881	AGT	2	6	216631	216636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464223
3497	NC_021881	A	6	6	216676	216681	100 %	0 %	0 %	0 %	526464223
3498	NC_021881	GCAT	2	8	216689	216696	25 %	25 %	25 %	25 %	526464223
3499	NC_021881	CAG	2	6	216720	216725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464223
3500	NC_021881	ATG	2	6	216738	216743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464223

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